現在の研究テーマには、大きく分けて以下のものがあります。
相模湾における沿岸生態系や、マレーシアにおけるサンゴ生態系、ナンキョクオキアミの生産生態学などの研究をしています。植物・動物プランクトン、バクテリアなどの低次栄養段階生物は、互いに複雑に依存し合いながら生態系を支えています。本研究室では、特に低次栄養段階生物群集とそれを取り巻く海洋環境に焦点を当てて研究を進めています。
都市環境から排出される汚水や生ごみ等の有機物を微生物によって分解する研究と、微生物や植物プランクトンを使った新しい汚水処理技術を研究・開発しています。メタン醗酵を利用し、有機物から効率良くエネルギーを取り出す研究も行っています。これらの研究は循環型社会において、今後、活用が期待されているバイオマスエネルギーの研究につながっていくものです。